中国司法鉴定 ›› 2022 ›› Issue (1): 85-92.DOI: 10.3969/j.issn.1671-2072.2022.01.012
骨骼肌circRNA在死亡时间推断中的初步筛选及验证研究
董婷婷, 肖作润, 刘增甲,等
济宁医学院 法医学与医学检验学院,山东 济宁 272067
Preliminary Screening and Verification of Skeletal Muscle circRNA in PMI Esitimation
DONG Tingting, XIAO Zuorun, LIU Zengjia, et al
Institute of Forensic Medicine and Laboratory Science, Jining Medical University, Jining 272067, China
摘要:
目的 通过构建骨骼肌中环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,筛选出人体骨骼肌中与死亡时间具有时序性变化的circRNAs,并对筛选出的circRNAs进行验证,进而探讨其相对表达量与死亡时间的相关性。方法 芯片实验选取2例外界温度、湿度相对一致,已知死亡时间在24 h内的个体,分别于尸检即刻(12 h以内)、3、5、7、10 d各取50 g组织进行总RNA提取,并进行逆转录、探针标记、基因芯片检测等实验,初步得到circRNA表达谱;对筛选出的circRNAs在后续收集的18例检材中进行验证,对所得数据进行统计分析。结果 骨骼肌组织中共检测出13 156个circRNAs,但在10 d内整体呈下降趋势的circRNAs只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_0000284、hsa_circ_0000520、hsa_circ_0001971 7个。对所筛选出的7个circRNAs在18例检材中进行验证,发现只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_0000284 5个circRNAs随着死亡时间增加,其相对表达量显著下降,具有统计学意义(P<0.05)。而hsa_circ_0000520、hsa_circ_0001971 2个circRNAs的表达为阴性。结论 circRNA是一种较为稳定的生物标记物,部分可用于死亡时间推断的研究。
中图分类号: