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云南红河地区彝族20个常染色体STR基因座的遗传多态性研究
魏 巍, 杨 杰, 徐冲冲, 卢晓筱, 袁晓坤, 杨 朔, 张寿勋, 夏 生, 黎 宽, 连心情, 钟树荣,
2023(3):
78-85.
DOI: 10.3969/j.issn.1671-2072.2023.03.011
目的 调查云南红河地区彝族人群20个常染色体短串联重复序列基因座的遗传多态性,分析云南红河彝族与其他不同群体的遗传关系,为法医学鉴定及群体遗传学研究提供基础数据。方法 收集2 342份云南红河彝族人群无关个体样本,Chelex-100法提取样本DNA,采用PowerPlex21 System试剂盒进行PCR复合扩增,用ABI 3130XL自动遗传分析仪对PCR复合扩增产物进行毛细管电泳分离,用GeneMapper ID-X 1.5软件进行STR分型。使用 Modified-Powerstats 软件统计等位基因频率及匹配概率等法医学参数,并进行Hardy-Weinberg平衡检验。使用 Arlequin软件计算Fst和 P 值。使用Phylip软件计算Nei’s遗传距离,使用 SPSS 软件进行多维尺度分析。应用Mega软件构建相邻连接系统发育树。结果 20个STR基因座中共观察到318个等位基因和1 314种基因型,各基因座等位基因频率和基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05/20=0.002 5)。20个STR基因座的累积个人识别能力达到0.999 999 999 999 999 999 999 999 729 502,累积非父排除概率达到0.999 999 994 995 179。Fst值、Nei’s遗传距离以及邻接法系统发育树的结果均提示,云南红河彝族与广西彝族、云南越南人群和云南佤族的遗传距离相对较远。结论 上述20个STR基因座在云南红河地区彝族群体中具有高度多态性,可用于法医学鉴定和群体遗传学研究。
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